La Ciudad de Wagrowiec está situada en la región de Wielkopolska al noreste de Polonia, 50 km al norte de Poznan, casi a la mitad de camino entre Varsovia y Berlin.

El área en le que se encuentra la ciudad se formó como consecuencia de la retírada e un glaciar de manera que la región es un terreno variado en cuanto al relieve. Al norte y al sur de la ciudad se extienden espacios llenos de colinas formadas por morenas frontales. En los alrededores de la ciudad hay los lagos, uno de los cuales (lago Durowskie) se encuentra en el mismo centro de la ciudad.

Constituye una atracción particular de la ciudad al ser el único en Europa y uno de los dos en el mundo que se forman como resultado de la confluencia de los ríos: el Nielba y el Welna.

La ciudad está situada en el cruce de ferrocarriles y autovias.